Исследование ассоциации с внезапной сердечной смертью однонуклеотидных полиморфизмов rs1008832 гена CACNA1C, rs4027402 гена SYNE2, rs2340917 гена TMEM43, rs58225473 гена CACNB2

Иванова А. А.; Мельникова Е. С.; Гуражева А. А.; Нестерец А. М.; Малютина С. К.; Родина И. А.; Хамович О. В.; Новоселов В. П.; Максимов В. Н.

Статья

Исследование ассоциации с внезапной сердечной смертью однонуклеотидных полиморфизмов rs1008832 гена CACNA1C, rs4027402 гена SYNE2, rs2340917 гена TMEM43, rs58225473 гена CACNB2

Иванова А. А.,

Мельникова Е. С.,

Гуражева А. А., Нестерец А. М.,

Малютина С. К.,

Родина И. А.,

Хамович О. В.,

Новоселов В. П.,

Максимов В. Н.

2022

https://doi.org/10.52727/2078-256X-2022-18-1-38-45

Однонуклеотидные полиморфизмы rs1008832 гена CACNA1C, rs4027402 гена SYNE2, rs2340917 гена TMEM43, rs58225473 гена CACNB2 найдены по результатам секвенирования клинического экзома группы мужчин, умерших внезапной сердечной смертью (ВСС) в возрасте до 45 лет, как возможные новые молекулярно-генетические маркеры ВСС. Целью исследования послужило изучение ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов rs1008832 гена CACNA1C, rs4027402 гена SYNE2, rs2340917 гена TMEM43, rs58225473 гена CACNB2 с ВСС в исследовании «случай-контроль» с использованием рутинных методов молекулярно-генетического анализа. Материал и методы. Группа ВСС (n = 400, средний возраст 53,2 ± 8,7 года, доля мужчин 70,9 %, женщин – 29,1 %) сформирована c использованием критериев ВСС Европейского общества кардиологов из анонимного банка ДНК лиц, умерших внезапной смертью (1999–2019 гг.). Контрольная группа (n = 400, средний возраст 53,1 ± 8,3 года, мужчины – 68,3 %, женщины – 31,7 %) подобрана по полу и возрасту к группе ВСС из банков ДНК живых на момент проведения исследований участников международных проектов MONICA и HAPIEE. Генотипирование проведено с использованием метода ПЦР с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов. Результаты. Не выявлено статистически значимых различий по частотам генотипов и аллелей однонуклеотидных полиморфизмов rs1008832 гена CACNA1C, rs4027402 гена SYNE2, rs2340917 гена TMEM43, rs58225473 гена CACNB2 между группой ВСС и контрольной группой (p > 0,05). Заключение. Не подтверждена ассоциация однонуклеотидных полиморфизмов rs1008832 гена CACNA1C, rs4027402 гена SYNE2, rs2340917 гена TMEM43, rs58225473 гена CACNB2 с ВСС.

Иванова А. А., Мельникова Е. С., Гуражева А. А., Нестерец А. М., Малютина С. К., Родина И. А., Хамович О. В., Новоселов В. П., Максимов В. Н. Исследование ассоциации с внезапной сердечной смертью однонуклеотидных полиморфизмов rs1008832 гена CACNA1C, rs4027402 гена SYNE2, rs2340917 гена TMEM43, rs58225473 гена CACNB2. Атеросклероз. 2022;18(1):38-45. https://doi.org/10.52727/2078-256X-2022-18-1-38-45

Цитирование

Список литературы

1. European detailed mortality database (DMDB) (2014), World Health Organization. Regional Office for Europe. Available at https://gateway.euro.who.int/, accessed September 25, 2021

2. Ревишвили А.Ш., Неминущий Н.М., Баталов Р.Е., Гиляров М.Ю., Голицын С.П., Давтян К.В., Думпис Я.Ю., Диденко М.В., Зенин С.А., Иваницкий Э.А., Комолятова В.Н., Кравцова Л.А., Криволапов С.Н., Кузовлев А.Н., Купцов В.В., Лебедев Д.С., Лебедева В.К., Линчак Р.М., Ломидзе Н.Н., Макаров Л.М., Миронов Н.Ю., Медведев М.М., Михайлов Е.Н., Недбайкин А.М., Нестеренко Л.Ю., Романов А.Б., Рзаев Ф.Г., Солохин Ю.А., Татарский Р.Б., Харлап М.С., Чапурных А.В., Шлевков Н.Б., Шубик Ю.В., С.м. Яшин К.э., Ревишвили А.Ш., Бойцов С.А., Голицын С.П., Егоров Д.Ф., Заклязьминская Е.В., Кузнецов В.А., Лебедев Д.С., Макаров Л.М., Мороз В.В., Покушалов Е.А., Попов С.В., Школьникова М.А., Шубик Ю.В., Яшин С.М. Всероссийские клинические рекомендации по контролю над риском внезапной остановки сердца и внезапной сердечной смерти, профилактике и оказанию первой помощи. Вестник аритмологии, 2017; (89): 2–104.

3. Database Gene. CACNB2, calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 [Homo sapiens (human)]. Available at https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/783, accessed October 25, 2021

4. Mazzanti A., Underwood K., Nevelev D., Kofman S., Priori S.G. The new kids on the block of arrhythmogenic disorders: Short QT syndrome and early repolarization. J. Cardiovasc. Electrophysiol., 2017; 28 (10): 1226–1236. doi: 10.1111/jce.13265

5. Soldatov N.M. CACNB2: An Emerging Pharmacological Target for Hypertension, Heart Failure, Arrhythmia and Mental Disorders. Curr. Mol. Pharmacol., 2015; 8 (1): 32–42. doi: 10.2174/1874467208666150507093258

6. Scheiper S., Ramos-Luis E., Blanco-Verea A., Niess C., Beckmann B.M., Schmidt U., Kettner M., Geisen C., Verhoff M.A., Brion M., Kauferstein S. Sudden unexpected death in the young – Value of massive parallel sequencing in postmortem genetic analyses. Forensic Sci. Int., 2018; 293: 70–76. doi: 10.1016/j.forsciint.2018.09.034

7. Hata Y., Kinoshita K., Nishida N. An Autopsy Case of Sudden Unexpected Death of a Young Adult in a Hot Bath: Molecular Analysis Using NextGeneration DNA Sequencing. Clin. Med. Insights. Case Rep., 2017; 10: 1179547617702884. doi: 10.1177/1179547617702884

8. Burashnikov E., Pfeiffer R., Barajas-Martinez H., Delpón E., Hu D., Desai M., Borggrefe M., Häissaguerre M., Kanter R., Pollevick G.D., Guerchicoff A., Laiño R., Marieb M., Nademanee K., Nam G.B., Robles R., Schimpf R., Stapleton D.D., Viskin S., Winters S., Wolpert C., Zimmern S., Veltmann C., Antzelevitch C. Mutations in the cardiac L-type calcium channel associated with inherited J-wave syndromes and sudden cardiac death. Heart Rhythm, 2010; 7 (12): 1872–1882. doi: 10.1016/j.hrthm.2010.08.026

9. Hu D., Barajas-Martinez H., Nesterenko V.V., Pfeiffer R., Guerchicoff A., Cordeiro J.M., Curtis A.B., Pollevick G.D., Wu Y., Burashnikov E., Antzelevitch C. Dual variation in SCN5A and CACNB2b underlies the development of cardiac conduction disease without Brugada syndrome. Pacing Clin. Electrophysiol., 2010; 33 (3): 274–285. doi: 10.1111/j.1540-8159.2009.02642.x

10. Database Gene. CACNA1C, calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C [Homo sapiens (human)]. Available at https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/775, accessed October 25, 2021

11. Jaouadi H., Bouyacoub Y., Chabrak S., Kraoua L., Zaroui A., Elouej S., Nagara M., Dallali H., Delague V., Levy N., Benkhalifa R., Mechmeche R., Zaffran S., Abdelhak S. Multiallelic rare variants support an oligogenic origin of sudden cardiac death in the young. Herz, 2021; 46 (Suppl 1): 94–102. doi: 10.1007/s00059-019-04883-1

12. Sutphin B.S., Boczek N.J., Barajas-Martínez H., Hu D., Ye D., Tester D.J., Antzelevitch C., Ackerman M.J. Molecular and functional characterization of rare CACNA1C Variants in sudden unexplained death in the young. Congenit. Heart Dis., 2016; 11 (6): 683–692. doi: 10.1111/chd.12371

13. Narula N., Tester D.J., Paulmichl A., Maleszewski J.J., Ackerman M.J. Post-mortem Whole exome sequencing with gene-specific analysis for autopsynegative sudden unexplained death in the young: a case series. Pediatr. Cardiol., 2015; 36 (4): 768–778. doi: 10.1007/s00246-014-1082-4

14. Database Gene. SYNE2, spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2 [Homo sapiens (human)]. Available at https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/23224, accessed October 25, 2021

15. Lee S.J., Lee S., Choi E., Shin S., Park J. A novel SYNE2 mutation identified by whole exome sequencing in a Korean family with Emery-Dreifuss muscular dystrophy. Clin. Chim. Acta, 2020; 506: 50–54. doi: 10.1016/j.cca.2020.03.021

16. Tsai C.T., Hsieh C.S., Chang S.N., Chuang E.Y., Juang J.M., Lin L.Y., Lai L.P., Hwang J.J., Chiang F.T., Lin J.L. Next-generation sequencing of nine atrial fibrillation candidate genes identified novel de novo mutations in patients with extreme trait of atrial fibrillation. J. Med. Genet., 2015; 52 (1): 28–36. doi: 10.1136/jmedgenet-2014-102618

17. Hsu J., Gore-Panter S., Tchou G., Castel L., Lovano B., Moravec C.S., Pettersson G.B., Roselli E.E., Gillinov A.M., McCurry K.R., Smedira N.G., Barnard J., van Wagoner D.R., Chung M.K., Smith J.D. Genetic control of left atrial gene expression yields insights into the genetic susceptibility for atrial fibrillation. Circ. Genom. Precis. Med., 2018; 11 (3): e002107. doi: 10.1161/CIRCGEN.118.002107

18. Martin R.I., Babaei M.S., Choy M.K., Owens W.A., Chico T.J., Keenan D., Yonan N., Koref M.S., Keavney B.D. Genetic variants associated with risk of atrial fibrillation regulate expression of PITX2, CAV1, MYOZ1, C9orf3 and FANCC. J. Mol. Cell. Cardiol., 2015; 85: 207–214. doi: 10.1016/j.yjmcc.2015.06.005

19. Database of Single Nucleotide Polymorphisms, dbSNP. rs2340917 Available at https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs2340917?vertical_tab=true, accessed October 25, 2021

Документы

Источник

Информация

Автор

Иванова А. А. Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
Мельникова Е. С. Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
Гуражева А. А. Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
Нестерец А. М. Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
Малютина С. К. Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»; Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Новосибирский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Родина И. А. Государственное бюджетное учреждение здравоохранения Новосибирской области «Новосибирское областное клиническое бюро судебно-медицинской экспертизы»
Хамович О. В. Государственное бюджетное учреждение здравоохранения Новосибирской области «Новосибирское областное клиническое бюро судебно-медицинской экспертизы»
Новоселов В. П. Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Новосибирский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации; Государственное бюджетное учреждение здравоохранения Новосибирской области «Новосибирское областное клиническое бюро судебно-медицинской экспертизы»
Максимов В. Н. Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»; Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Новосибирский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации

Название журнала

Атеросклероз

Ключевые слова

Статья