Статья
АССОЦИАЦИЯ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФИЗМОВ RS62116755 ГЕНА GACAT3, RS12170546 ГЕНА PARVB, RS16994849 ГЕНА PLCB1, RS78143315 ГЕНА PDCD6IP С ВНЕЗАПНОЙ СЕРДЕЧНОЙ СМЕРТЬЮ
А. А. Иванова,
В. Н. Максимов,
С. К. Малютина,
В. П. Новоселов,
С. В. Савченко,
М. И. Воевода
2017
Цель. Проверка ассоциации с внезапной сердечной смертью (ВСС) однонук- леотидных полиморфизмов rs62116755 гена GACAT3, rs12170546 гена PARVB, rs16994849 гена PLCB1, rs78143315 гена PDCD6IP, которые были выявлены в собственном полногеномном ассоциативном исследовании как молекулярно-генетические маркеры ВСС.Материал и методы. Группа ВСС (n=388, средний возраст 52,9±9,2 лет, мужчины — 77,2%, женщины — 22,8%) сформирована с использованием критериев ВСС Всемирной Организации Здравоохранения и Европейского общества кардиологов. Группа контроля (n=387, средний возраст 52,4±8,8 лет, мужчины — 62,3%, женщины — 37,7%) подобрана по полу и возрасту из банка ДНК международных исследований MONICA, HAPIEE. ДНК выделена методом фенол-хлороформной экстракции. Генотипирование выполнено методом полимеразной цепной реакции с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов.Результаты. Не выявлено ассоциации с ВСС однонуклеотидных полиморфизмов rs62116755 гена GACAT3, rs78143315 гена PDCD6IP. В группе ВСС доля носителей генотипа ТТ полиморфизма rs12170546 гена PARVB статистически значимо больше, а генотипа ТС значимо меньше, чем в контрольной группе (ОШ =1,66, 95% ДИ 1,25-2,21, p=0,001; ОШ =0,67, 95% ДИ 0,50-0,90, p=0,009, соответственно). В группе младше 50 лет частота носителей генотипа GG полиморфизма rs16994849 гена PLCB1 статистически значимо больше, а генотипа АА меньше по сравнению с контрольной группой (ОШ =4,92, 95% ДИ 1,01-23,20, p=0,032; ОШ =0,54, 95% ДИ 0,31-0,93, p=0,029, соответственно). В группе мужчин старше 50 лет доля носителей генотипа GG полиморфизма rs16994849 гена PLCB1 значимо меньше, чем в контрольной группе (ОШ =0,11, 95% ДИ 0,01-0,91, p=0,024).Заключение. Однонуклеотидные полиморфизмы rs62116755 гена GACAT3, rs78143315 гена PDCD6IP не связаны с ВСС. Генотип ТТ полиморфизма rs12170546 гена PARVB является генотипом риска ВСС, а генотип ТС обладает протективным эффектом в ее отношении. Генотип GG полиморфизма rs16994849 гена PLCB1 является генотипом риска ВСС для лиц младше 50 лет и обладает протективным эффектом в группе старше 50 лет. Генотип АА полиморфизма rs16994849 гена PLCB1 обладает протективным эффектом в отношении ВСС для лиц младше 50 лет.
Иванова А. А., Максимов В. Н., Малютина С. К., Новоселов В. П., Савченко С. В., Воевода М. И. АССОЦИАЦИЯ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФИЗМОВ RS62116755 ГЕНА GACAT3, RS12170546 ГЕНА PARVB, RS16994849 ГЕНА PLCB1, RS78143315 ГЕНА PDCD6IP С ВНЕЗАПНОЙ СЕРДЕЧНОЙ СМЕРТЬЮ. Российский кардиологический журнал. 2017;(10):23-28.
https://doi.org/10.15829/1560-4071-2017-10-23-28
Цитирование
Список литературы
1. Babenko VN, Maximov VN, Kulakova EV, et al. Genome analysis of pull DNA in human cohort. Vavilovsky zhurnal genetiki I selektsii, 2014; 18 (4-2): 847-55. (In Russ.) Бабенко В.Н., Максимов В.Н., Кулакова Е.В. и др. Полногеномный анализ пулированных выборок ДНК когорт человека. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2014; 18 (4-2): 847-55.
2. Priori SG, Aliot E, Blømstrom-Lundqvist C, et al. The Task Force for the Management of Patients with Ventricular Arrhythmias and the Prevention of Sudden Cardiac Death of the European Society of Cardiology (ESC). Europace 2015; 17 (11): 1601-87.
3. Sambrook J, Russell DW. Purification of nucleic acids by extraction with phenol: chloroform. CSH Protoc. 2006; 2006 (1).
4. GACAT3 gastric cancer associated transcript 3 (non-protein coding). Database Gene. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/104797537 (20 April 2017)
5. Sun W, Yang Y, Xu C, et al. Roles of long noncoding RNAs in gastric cancer and their clinical applications. J Cancer Res Clin Oncol. 2016; 142 (11): 2231-7.
6. Shen W, Yuan Y, Zhao M, et al. Novel long non-coding RNA GACAT3 promotes gastric cancer cell proliferation through the IL-6/STAT3 signaling pathway. Tumour Biol. 2016; 37 (11): 14895-902.
7. PARVB parvin beta. Database Gene. Режим доступа: https:// www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/29780 (20 April 2017)
8. Sepulveda JL, Wu C. The parvins. Cell Mol Life Sci. 2006; 63 (1): 25-35.
9. Verschuren JJ, Trompet S, Sampietro ML, et al. Pathway analysis using genome-wide association study data for coronary restenosis — a potential role for the PARVB gene. PLoS One. 2013; 8 (8): e70676.
10. PLCB1 phospholipase C beta 1. Database Gene. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/23236 (20 April 2017)
11. Lin YJ, Chang JS, Liu X, et al. Genetic variants in PLCB4/PLCB1 as susceptibility loci for coronary artery aneurysm formation in Kawasaki disease in Han Chinese in Taiwan. Sci Rep. 2015; 5: 14762.
12. PDCD6IP programmed cell death 6 interacting protein. Database Gene. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/10015 (20 April 2017)
13. Yu Q, Zhou C, Wang J, et al. A functional insertion/deletion polymorphism in the promoter of PDCD6IP is associated with the susceptibility of hepatocellular carcinoma in a Chinese population. DNA Cell Biol. 2013; 32 (8): 451-7.
Похожие публикации