Создание коллекции образцов плазмы для поиска диагностических биомаркеров глиальных опухолей

Омельчук Е. П.; Тимошкина Н. Н.; Гвалдин Д. Ю.; Петрусенко Н. А.; Росторгуев Э. Е.; Новикова И. А.; Кит О. И.

Статья

Создание коллекции образцов плазмы для поиска диагностических биомаркеров глиальных опухолей

Омельчук Е. П.,

Тимошкина Н. Н.,

Гвалдин Д. Ю.,

Петрусенко Н. А.,

Росторгуев Э. Е.,

Новикова И. А.,

Кит О. И.

2024

https://doi.org/10.15829/1728-8800-2024-4171

Цель. Создание коллекции образцов плазмы крови пациентовс опухолями головного мозга (ГМ) для разработки диагностической микроРНК (рибонуклеиновая кислота) панели глиальных опухолей.Материал и методы. Образцы плазмы крови пациентов с доброкачественными и злокачественными опухолями ГМ были получены путем двойного центрифугирования цельной крови, а затем заморожены при -75о С.Выделенные из плазмы крови 59 образцов РНК исследованы методом next-generation sequencing (NGS)-секвенирования.Результаты. На текущий момент в биобанке депонированы образцы 339 пациентов с первичными и вторичными опухолями ГМ и 10 человек контрольной группы (всего 698 образцов — по 2 аликвоты плазмы/человека), из которых 143 мужчины, 206 женщин. Возраст больных варьировал от 19 до 91 года, медиана составила 56 лет. Первичные опухоли ГМ (41%) включали две группы: доброкачественные (33,7%) и злокачественные (66,3%). Менингиомы составили основную часть (91%) группы доброкачественных новообразований. Среди злокачественных новообразований преобладали глиобластомы (46,7%) и астроцитомы (41,6%), а олигодендроглиомы и эпендимомы составили всего 9,1 и 2,5%, соответственно. Вторичные опухоли ГМ (59%) представлены рецидивирующими глиальными опухолями (92,5%) и метастатическими опухолями (7,5%) рака легких (71,4%) и рака молочных желез (28,6%). Внедрен протокол первичной подготовки образцов жидкостной биопсии, позволившей получить библиотеки ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота) высокого качества для выбранной платформы профилирования микроРНК.Заключение. Создание депозитария образцов плазмы крови является основой для поиска циркулирующих биомаркеров опухолей ГМ.

Омельчук Е. П., Тимошкина Н. Н., Гвалдин Д. Ю., Петрусенко Н. А., Росторгуев Э. Е., Новикова И. А., Кит О. И. Создание коллекции образцов плазмы для поиска диагностических биомаркеров глиальных опухолей. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2024;23(11):4171. https://doi.org/10.15829/1728-8800-2024-4171

Цитирование

Список литературы

1. Каприн А.Д., Старинский В.В., Шахзадова А.О. и др. Злокачественные новообразования в России в 2022 году (заболеваемость и смертность). М.: МНИОИ им. П.А. Герцена − филиал ФГБУ "НМИЦ радиологии" Минздрава России, 2023. С. 174. ISBN: 978-5-85502-290-2.

2. Klekner Á, Szivos L, Virga J, et al. Significance of liquid biopsy in glioblastoma–A review. J Biotech. 2019;298:82-7. doi:10.1016/j.jbiotec.2019.04.011.

3. Aalami AH, Abdeahad H, Shoghi A, et al. Brain tumors and circulating micrornas: a systematic review and diagnostic metaanalysis. Expert Rev Mol Diagn. 2022;22(2):201-11. doi:10.1080/14737159.2022.2019016.

4. Le Rhun E, Seoane J, Salzet M, et al. Liquid biopsies for diagnosing and monitoring primary tumors of the central nervous system. Cancer Lett. 2020;480:24-8. doi:10.1016/j.canlet.2020.03.021.

5. Berzero G, Pieri V, Mortini P, et al. The coming of age of liquid biopsy in neuro-oncology. Brain. 2023;146(10):4015-24. doi:10.1093/brain/awad195.

6. Омельчук Е.П., Тимошкина Н.Н., Росторгуев Э.Е. и др. Циркулирующие биомаркеры глиом (обзор литературы). Клиническая лабораторная диагностика. 2024;69(8):411-20. doi:10.51620/0869-2084-2024-69-8-411-420.

7. Wang J, Che F, Zhang J.Cell-free microRNAs as non-invasive biomarkers in glioma: a diagnostic meta-analysis. Int J Biol Marker. 2019;34(3):232-42. doi: 10.1177/1724600819840033.

8. Ma C, Nguyen HP, Luwor RB, et al. A comprehensive metaanalysis of circulation miRNAs in glioma as potential diagnostic biomarker. PLoS One. 2018;13(2):e0189452. doi:10.1371/journal.pone.0189452.

9. Гвалдин Д.Ю., Петрусенко Н.А., Росторгуев Э. Е. и др. Сравнительный анализ профиля циркулирующих микроРНК в плазме крови пациентов с глиальными опухолями мозга. Исследования и практика в медицине. 2024;11(2):36-45. doi:10.17709/2410-1893-2024-11-2-3.

10. Кособокова Е.Н., Калинина Н.А., Барышникова М.А. и др. Биоресурсные коллекции: алгоритмы формирования и функционирования, фундаментальная и прикладная значимость. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2023;22(11):3654. doi:10.15829/1728-8800-2023-3654.

11. Карандашов И.В., Гольбин Д. А., Горяйнов С. А. и др. Принципы биобанкирования и биобанки опухолей нервной системы в мировой практике. Вопросы нейрохирургии им. Н.Н. Бурденко. 2022;86(6):91-8. doi:10.17116/neiro20228606191.

12. Касымова А.Б., Жетписбаев Б.Б., Солодовников М.П. и др. Организация биобанка в нейрохирургии. Нейрохирургия и неврология Казахстана. 2021;3(64):3-10. doi:10.53498/24094498_2021_3_3.

13. Гольбин Д. А., Корочкина А. Л., Шугай С.В. и др. Опыт создания специализированного биобанка глиом головного мозга человека. Клиническая и экспериментальная морфология. 2020;9(4):39-49. doi:10.31088/CEM2020.9.4.39-49.

14. Кит О. И., Тимофеева С.В., Ситковская А.О. и др. Биобанк ФГБУ "НМИЦ онкологии" Минздрава России как ресурс для проведения исследований в области персонифицированной медицины. Современная онкология. 2022;24(1):6-11. doi:10.26442/18151434.2022.1.201384.

15. Красникова О.В., Кондратьева А.Р., Баду С.К. и др. Потенциальные диагностические биомаркеры глиом в жидких средах организма. Журнал медико-биологических исследований. 2022;10(1):52-63. doi:10.37482/2687-1491-Z090.

16. Karschnia P, Smits M, Reifenberger G, et al. A framework for standardised tissue sampling and processing during resection of diffuse intracranial glioma: joint recommendations from four RANO groups. Lancet Oncol. 2023;24(11):e438-50. doi:10.1016/S1470-2045(23)00453-9.

17. Reynoso-Noverón N, Mohar-Betancourt A, Ortiz-Rafael J. Epidemiology of brain tumors. In: Monroy-Sosa A, ed. Principles of neuro-oncology: brain & skull base. Springer/Cham. 2020:15-25. ISBN: 978-3-030-54879-7.

18. Алмабек А. Т., Кайдарова Д. Р., Ким В.Б. и др. Особенности лучевой терапии у пациентов с метастазами в головной мозг. Вестник Казахского Национального медицинского университета. 2021;(1):57-60. doi:10.53065/kaznmu.2021.84.42.013.

19. Пушкин А.А., Гвалдин Д.Ю., Тимошкина Н.Н. и др. Анализ данных высокопроизводительного секвенирования базы Gene Expression Omnibus для идентификации микрорибонуклеиновых кислот в плазме крови пациентов с глиобластомой. Исследования и практика в медицине. 2022;9(1):54-64. doi:10.17709/2410-1893-2022-9-1-5.

20. Аллилуев И.А., Пушкин А.А., Кузнецова Н. С. и др. Оценка диагностической значимости циркулирующих микроРНК в плазме крови пациентов с глиомами высокой степени злокачественности. Современные проблемы науки и образования. 2020;(6):135. doi:10.17513/spno.30309.

21. Гареев И.Ф., Новикова Л.Б., Бейлерли О.А. Циркулирующие микроРНК как новые потенциальные биомаркеры для диагностики высокозлокачественных глиом. Журнал неврологии и психиатрии им. C.C. Корсакова. 2019;119(5):86-90. doi:10.17116/jnevro201911905186.

22. Rehman AU, Khan P, Maurya SK, et al. Liquid biopsies to occult brain metastasis. Mol Cancer. 2022;21(1):113. doi:10.1186/s12943-022-01577-x.

23. Gvaldin DYu, Pushkin AA, Timoshkina NN, et al. Integratime analysis of mRNA and miRNA seprencing data for gliomas of various grades. Egypt J Med Hum Genet. 2020;21(73):1-17. doi:10.1186/s43042-020-00119-8.

24. Пушкин А.А., Гвалдин Д.Ю., Петрусенко Н.А. и др. Уровень опухолевых и внеклеточных микроРНК у пациентов с глиальными опухолями головного мозга. Современные проблемы науки и образования. 2023;(5). doi:10.17513/spno.32954.

Источник

Информация

Автор

Омельчук Е. П. ФГБУ "Национальный медицинский центр онкологии" Минздрава России
Тимошкина Н. Н. ФГБУ "Национальный медицинский центр онкологии" Минздрава России
Гвалдин Д. Ю. ФГБУ "Национальный медицинский центр онкологии" Минздрава России
Петрусенко Н. А. ФГБУ "Национальный медицинский центр онкологии" Минздрава России
Росторгуев Э. Е. ФГБУ "Национальный медицинский центр онкологии" Минздрава России
Новикова И. А. ФГБУ "Национальный медицинский центр онкологии" Минздрава России
Кит О. И. ФГБУ "Национальный медицинский центр онкологии" Минздрава России

Название журнала

Кардиоваскулярная терапия и профилактика

Ключевые слова

Статья