RT - article
SR - Electronic
T1 - Оптимизация протокола приготовления библиотек для секвенирования циркулирующих микроРНК плазмы и сыворотки
JF - Кардиоваскулярная терапия и профилактика
SP - 2026-01-23
DO - 10.15829/1728-8800-2025-4557
A1 - Киселева А. В., 
A1 - Сотникова Е. А., 
A1 - Жарикова А. А., 
A1 - Куценко В. А., 
A1 - Борисова А. Л., 
A1 - Шальнова С. А., 
A1 - Ершова А. И., 
A1 - Мешков А. Н., 
A1 - Драпкина О. М., 
YR - 2025
UL - https://www.cardiojournal.online/publication/13952
AB - Цель. Оптимизировать протокол приготовления библиотек для секвенирования микроРНК (малые некодирующие молекулы рибонуклеиновой кислоты) на основе коммерческого набора QIAseq miRNA UDI Library Kit для повышения качества получаемых данных.Материал и методы. Образцы плазмы и сыворотки крови четырех участников исследования были отобраны из коллекции биобанка ФГБУ "НМИЦ ТПМ" Минздрава России. Выделение рибонуклеиновой кислоты (РНК) проводилось для каждого образца параллельно из 200 и 300 мкл. Из каждого образца РНК с помощью набора QIAseq miRNA UDI Library Kit были приготовлены две библиотеки для секвенирования по двум вариантам протокола производителя: для 1 нг РНК с уменьшенным числом циклов амплификации и для 10 нг РНК. Секвенирование проводилось на NextSeq 550.Результаты. При сравнении групп образцов, приготовленных с использованием разных версий протокола, статистически значимо различались показатели тегов на млн прочтений (TPM, tags per million reads) на образец по генам человека (версия ENCODE v47) и по генам микроРНК (p<0,001).Заключение. Показано, что при использовании биообразцов плазмы и сыворотки крови основным параметром, влияющим на более высокие показатели секвенирования микроРНК, является уменьшение количества циклов полимеразной цепной реакции при приготовлении библиотек.