<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<xml>
 <records>
  <record>
   <ref-type name="Journal Article">17</ref-type>
   <contributors>
    <authors>
     <author>Киселева А. В.</author>
     <author>Сотникова Е. А.</author>
     <author>Жарикова А. А.</author>
     <author>Куценко В. А.</author>
     <author>Борисова А. Л.</author>
     <author>Шальнова С. А.</author>
     <author>Ершова А. И.</author>
     <author>Мешков А. Н.</author>
     <author>Драпкина О. М.</author>
    </authors>
   </contributors>
   <titles>
    <title>Оптимизация протокола приготовления библиотек для секвенирования циркулирующих микроРНК плазмы и сыворотки</title>
   </titles>
   <keywords>
    <keyword>микроРНК</keyword>
    <keyword>малые некодирующие РНК</keyword>
    <keyword>плазма</keyword>
    <keyword>сыворотка</keyword>
    <keyword>секвенирование следующего поколения</keyword>
    <keyword>оптимизация</keyword>
   </keywords>
   <dates>
    <year>2025</year>
    <pub-dates>
     <date>2026-01-23</date>
    </pub-dates>
   </dates>
   <doi>10.15829/1728-8800-2025-4557</doi>
   <journal>Кардиоваскулярная терапия и профилактика</journal>
   <abstract>Цель. Оптимизировать протокол приготовления библиотек для секвенирования микроРНК (малые некодирующие молекулы рибонуклеиновой кислоты) на основе коммерческого набора QIAseq miRNA UDI Library Kit для повышения качества получаемых данных.Материал и методы. Образцы плазмы и сыворотки крови четырех участников исследования были отобраны из коллекции биобанка ФГБУ &quot;НМИЦ ТПМ&quot; Минздрава России. Выделение рибонуклеиновой кислоты (РНК) проводилось для каждого образца параллельно из 200 и 300 мкл. Из каждого образца РНК с помощью набора QIAseq miRNA UDI Library Kit были приготовлены две библиотеки для секвенирования по двум вариантам протокола производителя: для 1 нг РНК с уменьшенным числом циклов амплификации и для 10 нг РНК. Секвенирование проводилось на NextSeq 550.Результаты. При сравнении групп образцов, приготовленных с использованием разных версий протокола, статистически значимо различались показатели тегов на млн прочтений (TPM, tags per million reads) на образец по генам человека (версия ENCODE v47) и по генам микроРНК (p&amp;lt;0,001).Заключение. Показано, что при использовании биообразцов плазмы и сыворотки крови основным параметром, влияющим на более высокие показатели секвенирования микроРНК, является уменьшение количества циклов полимеразной цепной реакции при приготовлении библиотек.</abstract>
   <urls>
    <web-urls>
     <url>https://www.cardiojournal.online/publication/13952</url>
    </web-urls>
   </urls>
  </record>
 </records>
</xml>
