%0 article
%A Киселева А. В., 
%A Сотникова Е. А., 
%A Жарикова А. А., 
%A Куценко В. А., 
%A Борисова А. Л., 
%A Шальнова С. А., 
%A Ершова А. И., 
%A Мешков А. Н., 
%A Драпкина О. М., 
%T Оптимизация протокола приготовления библиотек для секвенирования циркулирующих микроРНК плазмы и сыворотки
%D 2025
%R 10.15829/1728-8800-2025-4557
%J Кардиоваскулярная терапия и профилактика
%X Цель. Оптимизировать протокол приготовления библиотек для секвенирования микроРНК (малые некодирующие молекулы рибонуклеиновой кислоты) на основе коммерческого набора QIAseq miRNA UDI Library Kit для повышения качества получаемых данных.Материал и методы. Образцы плазмы и сыворотки крови четырех участников исследования были отобраны из коллекции биобанка ФГБУ "НМИЦ ТПМ" Минздрава России. Выделение рибонуклеиновой кислоты (РНК) проводилось для каждого образца параллельно из 200 и 300 мкл. Из каждого образца РНК с помощью набора QIAseq miRNA UDI Library Kit были приготовлены две библиотеки для секвенирования по двум вариантам протокола производителя: для 1 нг РНК с уменьшенным числом циклов амплификации и для 10 нг РНК. Секвенирование проводилось на NextSeq 550.Результаты. При сравнении групп образцов, приготовленных с использованием разных версий протокола, статистически значимо различались показатели тегов на млн прочтений (TPM, tags per million reads) на образец по генам человека (версия ENCODE v47) и по генам микроРНК (p<0,001).Заключение. Показано, что при использовании биообразцов плазмы и сыворотки крови основным параметром, влияющим на более высокие показатели секвенирования микроРНК, является уменьшение количества циклов полимеразной цепной реакции при приготовлении библиотек.
%U https://www.cardiojournal.online/publication/13952