@article{Киселева А. В.2026-01-23,
author = { Киселева А. В.,  Сотникова Е. А.,  Жарикова А. А.,  Куценко В. А.,  Борисова А. Л.,  Шальнова С. А.,  Ершова А. И.,  Мешков А. Н.,  Драпкина О. М.},
title = {Оптимизация протокола приготовления библиотек для секвенирования циркулирующих микроРНК плазмы и сыворотки},
year = {2025},
doi = {10.15829/1728-8800-2025-4557},
publisher = {NP «NEICON»},
abstract = {Цель. Оптимизировать протокол приготовления библиотек для секвенирования микроРНК (малые некодирующие молекулы рибонуклеиновой кислоты) на основе коммерческого набора QIAseq miRNA UDI Library Kit для повышения качества получаемых данных.Материал и методы. Образцы плазмы и сыворотки крови четырех участников исследования были отобраны из коллекции биобанка ФГБУ "НМИЦ ТПМ" Минздрава России. Выделение рибонуклеиновой кислоты (РНК) проводилось для каждого образца параллельно из 200 и 300 мкл. Из каждого образца РНК с помощью набора QIAseq miRNA UDI Library Kit были приготовлены две библиотеки для секвенирования по двум вариантам протокола производителя: для 1 нг РНК с уменьшенным числом циклов амплификации и для 10 нг РНК. Секвенирование проводилось на NextSeq 550.Результаты. При сравнении групп образцов, приготовленных с использованием разных версий протокола, статистически значимо различались показатели тегов на млн прочтений (TPM, tags per million reads) на образец по генам человека (версия ENCODE v47) и по генам микроРНК (p<0,001).Заключение. Показано, что при использовании биообразцов плазмы и сыворотки крови основным параметром, влияющим на более высокие показатели секвенирования микроРНК, является уменьшение количества циклов полимеразной цепной реакции при приготовлении библиотек.},
URL = {https://www.cardiojournal.online/publication/13952},
journal = {Кардиоваскулярная терапия и профилактика},
}