Биобанкирование в стационаре многопрофильного научного медицинского центра как потенциал для широкого спектра научных исследований. Часть I. Организационно-методические аспекты

Борисова А. Л.; Копылова О. В.; Покровская М. С.; Ефимова И. А.; Пустеленин А. В.; Ершова А. И.; Драпкина О. М.

Статья

Биобанкирование в стационаре многопрофильного научного медицинского центра как потенциал для широкого спектра научных исследований. Часть I. Организационно-методические аспекты

Борисова А. Л.,

Копылова О. В.,

Покровская М. С.,

Ефимова И. А.,

Пустеленин А. В.,

Ершова А. И.,

Драпкина О. М.

2023

https://doi.org/10.15829/1728-8800-2023-3749

Цель. Разработка алгоритма и организация сплошного биобанкирования образцов цельной крови, сыворотки и плазмы крови пациентов стационара ФГБУ "НМИЦ ТПМ" Минздрава России для создания подробно аннотированной, благодаря интеграции электронных историй болезни и базы данных биобанка, коллекции биообразцов.Материал и методы. В исследование включаются все пациенты, поступающие в стационар ФГБУ "НМИЦ ТПМ" Минздрава России в отделения разного профиля, подписавшие информированное согласие на биобанкирование. Клиническая информация собирается в рамках обследования пациентов и сохраняется в электронных историях болезни в медицинской информационной системе "Медиалог". Биобанкирование крови и ее производных осуществляется в соответствии со стандартными операционными процедурами. От каждого пациента в стандартных условиях сохраняется по 12 аликвот сыворотки и плазмы крови, а также 1 пробирка цельной крови с калиевой солью этилендиаминтетрауксусной кислоты (К2ЭДТА). Информация о биообразцах, идентификационные номера пациентов и координаты расположения в хранилище, содержатся в базе данных биобанка.Результаты. Разработан и внедрен в практику алгоритм сплошного биобанкирования биоматериала и данных стационарных пациентов. Коллекция, собираемая по данному алгоритму в течение 10 мес. и по настоящее время, связана с большими биомедицинскими данными, хранящимися в медицинской информационной системе, лабораторной информационной системе и биобанке. Объединенные базы данных позволяют вести поиск образцов в коллекции по заданным критериям.Заключение. Создаваемая по разработанному алгоритму коллекция подробно аннотированных биообразцов может быть использована для широкого спектра научных исследований путем формирования выборок пациентов по необходимым критериям. Разработанный алгоритм сплошного биобанкирования в стационаре может быть использован в различных медицинских центрах, оснащенных биобанками.

Борисова А. Л., Копылова О. В., Покровская М. С., Ефимова И. А., Пустеленин А. В., Ершова А. И., Драпкина О. М. Биобанкирование в стационаре многопрофильного научного медицинского центра как потенциал для широкого спектра научных исследований. Часть I. Организационно-методические аспекты. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2023;22(11):3749. https://doi.org/10.15829/1728-8800-2023-3749

Цитирование

Список литературы

1. Swede H, Stone C, Norwood A. National population based biobanks for genetic research. Genet Med. 2007;9:1419. doi:10.1097/GIM.0b013e3180330039.

2. Al Kuwari H, Al Thani A, Al Marri A, et al. The Qatar Biobank: background and methods. BMC Public Health. 2015;15:1208. doi:10.1186/s1288901525227.

3. Al Thani A, Fthenou E, Paparrodopoulos S, et al. Qatar Biobank Cohort Study: Study Design and First Results. Am J Epidemiol. 2019;188(8):142033. doi:10.1093/aje/kwz084.

4. Sudlow C, Gallacher J, Allen N, et al. UK biobank: an open access resource for identifying the causes of a wide range of complex diseases of middle and old age. PLoS Med. 2015;31;12(3):e1001779. doi:10.1371/journal.pmed.1001779.

5. Leitsalu L, Haller T, Esko T, et al. Cohort Profile: Estonian Biobank of the Estonian Genome Center, University of Tartu. Int J Epidemiol. 2015;44(4):113747. doi:10.1093/ije/dyt268.

6. McDavid A, Crane PK, Newton KM, et al. Enhancing the power of genetic association studies through the use of silver standard cases derived from electronic medical records. PLoS One. 2013;10;8(6):e63481. doi:10.1371/journal.pone.0063481.

7. Macheiner T, Huppertz B, Sargsyan K. Biobanking. Nachhaltige Nutzung biologischer Ressourcen am Beispiel der Biobank Graz [Biobanking. Sustainable use of biological resources on the example of the Biobank Graz]. Pathologe. 2013;34(4):3669. German. doi:10.1007/s0029201317527.

8. Копылова О. В., Ершова А. И., Покровская М. С. и др. Популяционно нозологический исследовательский биобанк "НМИЦ ТПМ": анализ коллекций биообразцов, принципы сбора и хранения информации. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2021;20(8):3119. doi:10.15829/1728880020213119.

9. Драпкина О. М., Шальнова С. А., Имаева А.Э и др. Эпидемиология сердечно сосудистых заболеваний и их факторов риска в регионах Российской Федерации. Третье исследование (ЭССЕРФ3). Обоснование и дизайн исследования. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2022;21(5):3246. doi:10.15829/1728880020223246.

10. Покровская М. С., Борисова А. Л., Метельская В. А. и др. Роль биобанкирования в организации крупномасштабных эпидемиологических исследований. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2021;20(5):2958. doi:10.15829/1728880020212958.

11. Покровская М. С., Сивакова О. В., Мешков А. Н. и др. Организация биобанкирования биообразцов в рамках второго этапа эпидемиологического исследования сердечно сосудистых факторов риска и заболеваний в регионах Российской Федерации (ЭССЕРФ2). Профилактическая медицина. 2018;21(22):445.

12. Покровская М. С., Борисова А. Л., Кондрацкая В. А. и др. Подходы к автоматизации преаналитического этапа крупномасштабных научных исследований в биобанке ФГБУ "НМИЦ ТПМ" Минздрава России. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2022;21(11):3404. doi:10.15829/1728880020223404.

13. Копылова О. В., Ершова А. И., Ефимова И. А. и др. Электронные истории болезни и биобанкирование. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2022;21(11):3425. doi:10.15829/1728880020223425.

14. Брызгалина Е. В., Глотов А. С. Этические аспекты работы биобанка. В кн.: Биобанкирование. Национальное руководство. Москва: ООО "Издательство ТРИУМФ", 2022. c. 132153. ISBN 9785936733222.

15. Bledsoe MJ. Ethical Legal and Social Issues of Biobanking: Past, Present, and Future. Biopreserv Biobank. 2017;15(2):1427. doi:10.1089/bio.2017.0030.

16. Покровская М. С., Кондрацкая В. А., Ефимова И. А. Особенности биобанкирования и контроля качества образцов биологических жидкостей. Кровь, сыворотка, плазма. В кн.: Биобанкирование. Национальное руководство. Москва: ООО "Издательство ТРИУМФ", 2022. С. 185207. ISBN: 9785936733222.

17. Mooser V, Currat C. The Lausanne Institutional Biobank: a new resource to catalyse research in personalised medicine and pharmaceutical sciences. Swiss Med Wkly. 2014;4(144):w14033. doi:10.4414/smw.2014.14033.

18. Bernasconi L, Şen S, Angerame L, et al. Legal and ethical framework for global health information and biospecimen exchange — an international perspective. BMC Med Ethics. 2020;21(1):8. doi:10.1186/s1291002004489.

19. Lecaros JA. Biobanks for Biomedical Research: Evolution and Future. In: Valdés E, Lecaros JA (eds). Handbook of Bioethical Decisions. 2023;Vol.I. Collaborative Bioethics, vol 2. Springer, Cham. doi:10.1007/9783031294518_17.

Документы

Источник

Информация

Автор

Борисова А. Л. ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины" Минздрава России
Копылова О. В. ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины" Минздрава России
Покровская М. С. ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины" Минздрава России
Ефимова И. А. ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины" Минздрава России
Пустеленин А. В. ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины" Минздрава России
Ершова А. И. ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины" Минздрава России
Драпкина О. М. ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины" Минздрава России

Название журнала

Кардиоваскулярная терапия и профилактика

Ключевые слова

Статья

Похожие публикации

Документы

Источник

Информация